Développer et utiliser des pipelines bioinformatiques pour nettoyer et analyser des génomes bactériens, et leurs lien avec des phénotypes hôtes notamment épidémiologiques (contenu en gènes, inférence phylogénétique, analyses de pangénomes, identification de SNPs, étude d'association, etc.)
Communiquer les résultats à des conférences scientifiques.
Publier les résultats dans des journaux scientifiques.
Activités
- Analyser des données génomiques bactériennes
- Présenter des résultats à des conférences scientifiques
- Ecrire des publications scientifiques pour communiquer les résultats
Compétences
Expérience en génomique et bioinformatique.
Expérience ou intérêt fort pour étudier l'évolution de génomes bactériens.
Bonnes compétences quantitatives.
Contexte de travail
Le postdoctorant rejoindra deux groupes de recherche : l'un au Quartier Latin au centre de Paris (Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie, UMR CNRS 7241, Collège de France) spécialisé dans les modèles mathématiques pour étudier l'évolution, l'autre sur le campus de la Faculté de Médecine Bichat à le Nord de Paris (Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution, UMR INSERM 1137) spécialisé en écologie & évolution des maladies infectieuses. Ces groupes offrent des opportunités de collaborations avec des mathématicens, des bioinformaticiens, des médecins et des biologistes.
Contraintes et risques
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sur le site du recruteur.